代谢病的主要危害除了其本身异常造成的疾病，例如：低血糖昏迷、糖尿病酮症酸中毒、糖尿病性骨质疏松、低钙抽搐、痛风关节炎、低蛋白浮肿、尿毒症等以外。更重要的是其衍生的身体各器官损害。例如：糖尿病血管病变引起的失明、冠心病、肾功能衰竭等；高血脂引起动脉粥样硬化导致的冠心病、脑中风、肢体血管缺血、肾功能衰竭、脂肪肝（肝硬化）；钙代谢异常导致骨质疏松（导致易骨折等）症；血管病变基础上发生高血压，高血压又会导致一系列靶器官损害，如心、脑、肾病变。